正常月经第3-4日时，分泌期子宫内膜已全部脱落;黄体萎缩不全时，月经期第5-6日，仍能见到呈分泌反应的子宫内膜。常表现为混合型子宫内膜，即残留的分泌期内膜与出血坏死组织及新增生的内膜混合共存。
由于下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能紊乱，引起黄体萎缩不全，内膜持续受孕激素影响，以致不能如期完整脱落。表现为月经周期正常，但经期延长，长达9-10日，且出血量多。
治疗上首先给予补充孕激素治疗，如口服甲羟孕酮;有生育要求者可以注射黄体酮注射液;无生育要求者也可口服避孕药来控制周期。
客观来说，黄体萎缩不全是有可能自愈的。因为黄体是一个周期一个周期的，这个周期的黄体萎缩不全，不能代表下个周期的黄体就一定萎缩不全。
但是，临床上一旦诊断明确，就应该予孕激素后半周期调经治疗，没有诊断明确后给予观察随访的。因为黄体萎缩不全时，月经期延长，淋漓不净，容易感染。
另外，给予观察随访，难保下个周期就一定正常。所以，被动等待，不与主动干预。按照目前异常子宫出血的九分法，黄体萎缩不全应该属于排卵障碍性异常子宫出血。
女性如果黄体萎缩不全或者黄体功能不全，都有可能导致月经紊乱，可能会出现月经经期延长、月经淋漓不尽或者月经提前、月经周期缩短等现象。
女性黄体是出现在排卵期之后形成的，黄体释放黄体激素也就是黄体酮。如果黄体过早的萎缩、功能不全，会导致子宫内膜提前脱落，出现月经提前、月经周期缩短，有可能导致女性贫血。
如果黄体萎缩不全，有可能使引起女性在月经结束后淋漓出血或者月经经期延长，有可能导致女性生殖系统感染。这两种疾病都有可能导致女性没有成熟卵泡排出，也会引起不孕。
