这个损伤包括宫颈、宫体、子宫内膜的损伤。做人流时，器械要经宫颈进入宫腔内操作。进行吸刮或钳刮术时，子宫内膜的基底层易受损伤，创面可发生粘连。如果修补不及时，可能导致继发不孕或反复自然流产。
做人流时，器械要经阴道进入宫腔内操作，如果患者有炎症，很容易引发子宫内膜炎、输卵管炎、盆腔炎等，感染可能造成不孕。
突然终止妊娠会导致女性内分泌紊乱，进而出现月经不调、闭经、不排卵等症状，造成不孕。
因为正常的分娩是按一定规律进行的，机体对此有充足的适应和准备时间，而人为中断怀孕，机体因内分泌功能突然下降，没有缓慢的适应过程，会造成隐性伤害。
据统计，人工流产后近1%伴发感染，感染将带来子宫内膜和输卵管炎症，而子宫内膜及输卵管炎症是造成异位妊娠的重要原因。
有些人工流产手术由于损伤了子宫内膜肌层，造成再次妊娠时胎盘血液循环障碍，引起胎盘功能不全，以致胎儿缺氧，生长过缓，早产死胎和新生儿死亡率增高。
人流手术对女性的心理会造成很大的阴影，会给生活带来很多负担。很多有过人流经历的女性朋友都有心灵创伤，她们后悔，无助，绝望，焦虑，甚至出现离婚，婚外恋等现象，而心理障碍有时候比身体的伤害更大。
