新生儿通常会皮肤红润，但出生后的几小时内，宝宝的手指和脚趾可能因为血液循环欠佳而略显青紫。若骨骼压力破坏了某些脂肪组织，宝宝的皮肤上就可能出现一些硬肿块，常见于宝宝的头部、面颊和脖子处，特别是生产过程中使用过产钳的地方。这些硬块可能会向皮肤表面破溃并流出少许清亮的黄色液体，一般情况下，愈合速度会很快。
如果是头位顺产，宝宝出生后的几天头部会有少许的变形。这是因为宝宝出生时为顺应产道，头部被挤压颅骨会有所重叠，因此会出现象征性的头皮水肿和头皮挫伤，有时宝宝的颅骨骨膜下会出血，并在头部皮下组织形成小血肿，通常要数星期后才能消退。
如果胎儿是臀位生产（屁股先出现），头部通常就不会变形，但宝宝的臀部、生殖器或脚会出现水肿和青紫。如果是臀位，医生通常会建议进行剖腹产，这样能够降低宝宝的出生风险，避免难产。
此外，若是生产过程中产道挤压导致支配面部肌肉的某些神经损伤，可能导致宝宝脸部不对称，但会在出生后的几周逐渐恢复。
医生将听诊器放在新生儿胸前进行心肺功能检查，来诊断宝宝是否存在异常，还会观察新生儿的皮肤颜色和整体身体状态，看有无疾病的体征，并检查脉搏跳动的力量。
宝宝出生后，还需要检查神经系统是否正常，多为检查新生儿的3种重要神经反射，包括拥抱反射、觅食反射和吸吮反射：拥抱反射，当新生儿受到惊吓时，上下肢会以较慢的速度向外、向前摆动，手伸展；觅食反射，触摸宝宝的一侧嘴唇，他会将头转向碰触的这边，这个反射能帮新生儿找到乳头；吸吮反射，把某物体放进新生儿的嘴巴里，他会马上开始吸吮。
血液检查
宝宝刚出生时，因为不易发现，表面的检查可能会错过某些严重缺陷而对宝宝的健康成长造成阻碍，因此需要进行血液检测以及早发现和治疗缺陷，避免畸形。特别是母亲患有传染性疾病的情况下，一定要进行血液检查，避免发生败血症等疾病。
新生儿腹部检查包括检查形状和尺寸，以及检查内脏器官如肾脏、肝脏和脾脏的大小、形状和位置。如果有肾脏肿大可能预示着尿路梗阻。
四肢检查包括检查新生儿的上、下肢及髋关节的弹性和活动度以发现有无关节错位。
医生还会检查新生儿的生殖器，包括看尿道是否有开口以及是否在正常位置。
男婴的睾丸应该在阴囊里面，女婴因为母亲激素的作用，阴唇明显，并且在出生后的几周内呈水肿状态。
医生还会检查宝宝的肛门以确定开口是否闭锁。
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