部分患者感染非淋后，随着时间的推移，症状较发病时有明显的减轻，出现分泌物减少甚至消失，还有部分患者使用抗生素治疗后症状缓解，但并不是非淋已经自愈或治愈。
一方面非淋感染后随时间的延长或不规范的治疗，临床症状可以缓解或消失，另一方面，非淋患者可以没有明显或有较轻微的临床症状。一旦感染非淋或是有过危险的性生活接触，建议到医院进行规范治疗，应在一周左右的潜伏期后进行筛查，排除是否有支原体和衣原体的感染。
得了非淋菌性尿道炎一定要积极治疗，这种疾病，是不可能自己康复的，如果不治疗病情会变得越来越严重。治疗非淋菌性尿道炎可用的药物很多，在临床上由于强力霉素、四环素、红霉素已经对不少菌株产生了耐药性。
非淋菌性尿道炎是因性交传染的一种尿道炎，尿道或宫颈分泌物涂片或培养可查到沙眼衣原体和解脲支原体、人型支原体等多种特异性的微生物，是一种较常见的尿道感染。
非淋菌性尿道炎的治疗要根据病原体来选择抗生素，主要针对沙眼衣原体和支原体，推荐的方案为阿奇霉素或多西环素，替代方案包括红霉素、左氧氟沙星。
妊娠期妇女的替代方案是阿奇霉素口服，单次给药，患者性伴侣需同时检查治疗，在治疗结束前双方应避免性接触。
治疗痊愈的标准，临床症状消失一周，尿液澄清、尿道口无分泌物、尿沉渣镜检阴性，以及尿道、宫颈刮片涂片阴性，且支原体、衣原体检查阴性。
非淋菌性尿道炎的病因主要是由于沙眼衣原体和支原体引起的感染。因为此类微生物对药物并不敏感，所以常规的消炎药治疗，或者短时间的用药，并不能把衣原体或者支原体清除干净。故而，此病需要较长的一个疗程，一般需要用药两周，甚至更长时间。用药两周，症状消失后，建议过一周再进行检测，若检测到衣原体或支原体均呈阴性，即为治愈。
非淋球菌性尿道炎是指由性接触传染的一种尿道炎，它在临床上有尿道炎的表现，但在尿道分泌物中查不到淋球菌，可通过性传播，非淋菌性尿道炎是可以治愈的，建议及时到做药敏试验，明星美国抗生素进行治疗，一般多选用大环内酯类抗生素治疗。及时用药一般在2-3周症状逐渐恢复，治疗期禁止性生活，不吃辛辣刺激食物不饮酒。
