在清宫手术时，医生是无法看到子宫里面的情况，只能根据临床经验和感觉来进行操作，所以在这个过程中有可能过度刮宫，造成子宫伤害，破坏子宫正常功能。
如果刮宫不完全，会造成少数的胚胎组织残留在子宫，当子宫收缩时会出现腹痛的症状，另外还可能导致出血黏连、感染等症状。
如果是在小心的医院或者诊断，器械的消毒工作往往不到位，无菌意识较差，容易出现手术感染的现象，或者是清宫术后自身的不注意导致感染。
清宫手术需要做扩宫，此时如果医生的动作过于粗滤，则可能造成子宫颈内膜手上、发炎从而使子宫颈或内膜黏连。
