甲状腺功能减退，大部分由自身免疫性损伤引起。甲减最常见的原因是桥本甲状腺炎，桥本甲状腺炎属于自身免疫性疾病，是免疫系统误将甲状腺当作敌人进行攻击破坏，使甲状腺功能减退。妊娠期最常见的是妊娠期亚临床甲减，亚临床甲减是为胎儿创造一个最佳的环境，而定的一个相对性的诊断名称，如果女性无妊娠，则不存在该疾病。
妊娠期亚临床甲减时，若促甲状腺激素控制在2.5mIU/L以内，最佳数值为1.5mIU/L以内的正常范围，需由专业的医生来判断和治疗。另外，如果妊娠合并有甲减时应及时诊断和快速进行治疗，因为甲状腺激素参与胎儿大脑和神经系统的发育。
孕妇甲减没有好好治疗的话对胎儿的影响的确是多方面的的。
胎儿脑发育所需要的甲状腺激素，全部来源于母体，特别是孕早期，胎儿神经系统发育很快，如果孕妇甲减就会影响到胎儿智力。母体甲状腺激素缺乏，可以导致后代胎儿神经系统发育、成熟都有障碍，影响以后后代的智力。研究表明，如果没有补充左甲状腺激素，后代包括胎儿大脑发育就受到影响，智商降低。如果给予及时补充，而且补充剂量合适，像甲状腺激素补充尽量得到及时保障，后代智商影响就不大。
同时甲状腺激素另外一个非常重要的作用，就是和胎儿骨骼发育密切相关。如果甲状腺激素减少，孕期甲减没有得到左甲状腺激素补充，胎儿骨骼就不能够正常形成和发育，比如孕期甲减造成胎儿甲状腺受损害以后，出现的叫做呆小症。
因此孕妇甲减，如果临床发现存在孕妇甲状腺功能有问题、甲状腺功能减退，无论是临床甲减，还是亚临床甲减，都需要在内分泌科医生，和妇产科医生配合下，进行及时诊断，正确选择药物剂量，而且定期复查。
孕妇甲减的治疗分以下两种情况：一、孕前已经患有甲减的，孕期继续口服左甲状腺素片治疗，并根据孕周甲状腺激素的变化调整药物的剂量，既要将甲状腺激素控制正常，也要将促甲状腺激素在早孕期控制于2.5mU/L以下，在中孕、晚孕期控制于3.0mU/L以下。二、孕前甲状腺功能正常，妊娠期间甲状腺激素水平也正常，只是促甲状腺激素水平稍高，这个时候如果甲状腺自身抗体阳性，血液中促甲状腺激素水平高于2.5mU/L就要给予左甲状腺素片治疗;如果自身抗体阴性，血液中促甲状腺激素一般在高于4.0mU/L的时候，才给予左甲状腺素片治疗，控制的标准同前面一样;这种妊娠期甲减，一般不需要长期治疗。
