1、血、尿胆红素：结合和未结合胆红素均升高，且多以直接胆红素增高为主，尿胆红素阳性。
2、酶学改变：谷丙转氨酶(ALT)升高程度不一，低者可仅略高出正常值，高者可>200U，多数临床好转后，ALT下降，部分病儿则临床好转而ALT反比原来升高，然后再下降。
3、甲胎球蛋白测定：正常新生儿甲胎蛋白阳性，约至生后1个月时转阴，如用定量法，则仍在正常值以上，新生儿肝炎患婴则满月甲胎蛋白仍阳性(可能为新生肝细胞的作用)，且可持续达5～6个月之久，如用定量法动态观察之，则可见其随着病情的好转而下降，若甲胎蛋白不下降，临床症状缓解，可能为肝脏严重损害到不能再生的程度，示病情严重。
4、病原学检测：对患儿胎粪、外耳道、结膜、鼻咽或羊水取标本涂片，革兰染色找细菌。血液乙型肝炎病毒标志、CMV、单纯疱疹、风疹、弓形虫抗体(IgG和IgM)及2周后血清对比。其他如尿液细菌培养、CMV培养、母亲“TORCH”抗体检查等。
肝胆超声影像、胆道闪烁扫描、十二指肠液颜色分析及核素计数，对有淡黄色或土色粪便的患儿与胆道闪烁扫描同步进行。
