可能是宝宝肚子有蛔虫引起的消化不良，造成失眠、烦躁和夜间磨牙。另外，蛲虫也会引起磨牙。蛲虫平时寄生在人体的大肠内，宝宝入睡以后，蛲虫会悄悄地爬到肛门口产卵，引起肛门瘙痒，使宝宝睡得不安稳，出现磨牙。
可能是宝宝晚上吃得太多可，增加胃肠道的负担。入睡时，胃肠道里还积存着大量没有被消化的食物，整个消化系统就不得不“加夜班”，连续工作，甚至连咀嚼肌也被动员起来，不由自主地收缩，引起磨牙。
由于体内钙、磷代谢紊乱，会引起骨骼脱钙，肌肉酸痛和植物神经紊乱，常常会出现多汗、夜惊、烦躁不安和夜间磨牙。
可能是白天受到了什么刺激，导致神经系统过于兴奋，也会出现夜间磨牙。另一个原因是压力大，如不适应幼儿园生活、害怕班里的某个小朋友、与父母或者家人争吵等，都会令宝宝的精神紧张，导致宝宝晚上睡觉磨牙。此外，一些过度活跃的宝宝也会发生夜间磨牙。
牙齿排列不齐咀嚼肌用力过大或长期用一侧牙咀嚼，以及牙齿咬合关系不好，发生颞下颌关节功能紊乱，也会引起夜间磨牙。而且，牙齿排列不整齐的宝宝，咀嚼肌的位置也往往不正常，晚上睡眠时，咀嚼肌常常会无意识地收缩，引起磨牙。
如果宝宝睡觉时头经常偏向一侧，会造成咀嚼肌不协调，使受压的一侧咀嚼肌发生异常收缩，因而出现磨牙。宝宝晚上蒙着头睡觉，由于二氧化碳过度积聚，氧气供应不足，也会引起磨牙。
