紫草味苦、成，性寒，入心、肝、小肠经，味苦能清热，寒能凉血，故有较好的凉血止血功效，常用于紫癜、吐血、衄血、尿血等疾病。
腹腔注射给予紫草色素成分(紫草素、乙酰紫草素)不影响血液凝固时间，但可阻止肝素的抗凝血作用。这种作用可拮抗凝血抑制因子，促进静脉瘤等的血栓形成。
紫草提取物(B，B-二甲基内烯酰紫草素、B，B-二甲基丙酰紫草素、乙酰紫草素和B-乙酰氧基异成酰紫草素)部分，在浓度为0.25mg/ml培养液条件下，对Hela细胞DNA合成后期(G2期)有一定抑制作用，使之推迟进入分裂，导致分裂指数下降，开始4小时分裂指数下降70%。但对该细胞摄取3H-胸腺嘧啶核苷无抑制作用，故对DNA合成无影响;对分裂中期有类似秋水仙素的作用，但作用较缓和，故紫草除影响细胞G2期外，还可能干拢了其他环节。
草根(日本产)乙醇提取液及紫草根为末混合喂饲动物，均可抑制大鼠动情期，根中提取的色素成分则无效。给小白鼠灌胃50%国产紫草糖浆或10%紫草药饵，有明显抑制动情周期及生育力的效果，停药后，动情周期及生育力均恢复。
从硬紫草中得到的紫草多糖A，B，C(Lithopermana)(A，B，C)，当给予100mg/kg剂量时，腹腔注射，对正常小鼠的血糖下降率(%)分别为64、83、55，其中多糖B、C可维持24小时对四氧嘧啶诱发高血糖小鼠，只有多糖A在给药7小时后降糖率达51。
紫草能清热，寒能凉血止血，还有杀虫之功，常用于湿疹、下焦湿热引起的淋浊、肝胆湿热性黄疸等症。
由于素体阳盛，肠胃积热，过食辛热厚味，导致肠道失润，于是大便干结，难于排出，小便短赤，面红身热，兼有腹胀腹痛，口干口臭，舌红苔黄，脉滑数。治宜可选味苦而寒的紫草，清热泄火，润肠通便。
1、发斑疹：钩藤钩子、紫草茸各等分。上为细末，每服一字或五分、一钱，温酒调下，无时。(《小儿药证直诀》紫草散)
2、治疮疹才初出，便急与服之，令毒减轻可：紫草(去粗梗)二两，陈橘皮(去白，焙干)一两。上为末，每服一大钱，水一盏，入葱白二寸，煎至六分，去渣温服，无时。乳儿与乳母兼服之，断乳令自服。(《小儿卫生总微论方》紫草如圣汤)
3、预防麻疹：紫草三钱，甘草一钱。水煎，日服二次。(《吉林中草药》)
4、治过敏性紫癜：紫草五钱，蝉蜕二钱，当归四钱，竹叶三钱，西河柳三钱，牛蒡子三钱，黄柏三钱，知母三钱，苦参三钱。水煎服。(新疆中草药手册》)
5、治血小板减少性紫癜：紫草二钱，海螵蛸五钱，茜草二钱。水煎服。(《新疆中草药手册》)
6、治热疮：紫草茸、黄连、黄柏、漏芦各半两，赤小豆、绿豆粉各一合。上药捣细，入麻油为膏，日三敷，常服黄连阿胶丸清心。(《仁斋直指方》紫草膏)
7、治小儿胎毒，疥癣，两眉生疮，或延及遍身瘙痒，或脓水淋沥，经年不愈：紫草、白芷各二钱，归身五钱，甘草一钱，麻油二两。同熬，白芷色黄为度，滤清，加白蜡、轻粉各二钱，取膏涂之。(《疡医大全》紫草膏)
8、治火烫，发泡腐烂：紫草一钱，当归五钱，麻油四两。上三味，同熬药枯，滤清去渣，将油再熬，加黄蜡五钱，熔化，倾入碗内，顿冷，涂之。(《幼科金针》紫草润肌膏)
9、治痈疽便闭：紫草、栝楼等分。新水煎服。(《仁斋直指方》)
10、治小便卒淋：紫草一两。为散，每食前用井华水服二钱。(《千金翼方》)
11、治血淋：紫草、连翘、车前子各等分，水煎服。(《证治准绳》)
12、治吐血衄血不大凶，亦不尽止，起居如故，软食如常，一岁之间，或发二、三次，或发五、六次，久必成痨：紫草、怀生地各四两，白果肉百个，茯苓、麦门冬各三两。煎膏，炼蜜收，每早、晚各服十余匙，白汤下。(《方脉正宗》)
13、治五疸热黄：紫草三钱，茵陈草一两。水煎服。(《本草切要》)
14、治赤游丹毒，红晕如云头：用小锋刀或磁碗锋画去毒血，紫草五钱，鼠粘子一两。研细，水煎服。(《本草汇言》)
15、治小儿白秃：紫草煎汁涂之。(《圣惠方》)
16、治豌豆疮，面齄，恶疮，瘑癣：紫草煎油涂之。(《医学入门》)
17、治恶虫咬：油浸紫草涂之。(《圣惠方》)
