用于脾胃虚弱，食少便溏，倦怠乏力之症，以及脾虚泄泻，久泻脱肛等。北芪的补气力强，善补肺气，可以治疗肺虚气短，声低懒言、神疲乏力，容易感冒之症。常配党参、白术、淮山、炙甘草同用。用蜜制后的北芪补益力更强。
用于表虚自汗。北芪补气之中而有外达之性，故能补气固表以止汗。北芪的固表止汗作用较好。临床上通过不同配伍，能治疗各种汗出症;同助阳药配伍，治阳虚自汗;同补气药配伍，治疗气虚自汗;同滋补药配伍，治阴虚盗汗。若气血不足，外受风寒，又往往不能作汗，在解表药中配伍黄芪，能鼓舞阳气，补益汗源，使其发汗，所谓“黄芪有汗能止，无汗能发”就是这个道理。这时宜生用。
用于气虚下陷之症。中医认为脏器的下垂是由于中气下陷之故，北芪善于益气升阳，可治疗脱肛、子宫脱垂、胃下垂、肾下垂以及气虚血脱的崩漏等症。中医用补中益气汤治疗脏器下垂各症，补中益气汤中的北芪就是取其补气之中而有上升之性，能升脾胃之清阳。这时宜蜜制后用。
用于气虚水肿，常配白术、防己、炙甘草或桂枝、茯苓同用，如防己黄芪汤、防己茯苓汤均有本品。多用于治疗慢性肾炎蛋白尿、糖尿病晚期等。
用于气虚痈疽久不溃破，或溃后久不愈合，常与党参、肉桂同用。取本品补气健脾，能促进脓疱的早溃和肌肉的新生，有排脓生肌作用。
北芪为重要的补气药，全身之气皆能补益。能补脾健胃、补肺益气、补气固气、补气消肿、补气生血、补气通络、补气升提、补气托毒、排脓生肌。古人把北芪推崇为“补气诸药之最”。
另外，中医认为补气有助生血，所以在治疗各种血虚症时加入补气的北芪、党参可以加强补血作用，如具有健脾养心、补血益气作用的归脾汤。北芪还有降血糖的作用，所以常与淮山、生地黄、天花粉、五味子等配伍治疗糖尿病(消渴病)。对癌症放化疗期间使用北芪可增强抗癌药的效果，减轻放化疗的不良反应，保护正常细胞，防止骨髓抑制。中医还有一条名方就是补阳还五汤，汤中重用北芪四两，治疗中风后遗症的半身不遂，效果非常好。
