胎儿耳朵畸形跟遗传有一定的关系，比如父母本身在某一方面有生理缺陷，这可能使他们的生殖细胞中也有缺陷，这种缺陷传给下一代，就能导致出现如外耳道闭锁、中耳畸形、内耳发台不全等先天性耳聋病。
建议准爸妈备孕期就做好全面的孕前检查，若身体有异常应治疗好后再怀孕。且孕前检查还能提前得知胎儿患病的几率。
孕期准妈妈用药不当也是导致胎儿耳朵畸形的重要原因之一。比如服用了抗感冒、抗菌素类药物或维甲酸类药物，会导致胎儿先天性小耳畸形。还有一种帮助孕妇止吐的药物会导致胎儿出生后缺耳朵。以链霉素和庆大霉素为首的氨基甙类抗生素会直接毒害胎儿听觉器官。
因此，孕期准妈妈用药一定要谨慎，应在医生的指导下用药，绝不可自行盲目用药，尤其是孕早期胎儿发育的关键时期。
孕早期时，准妈妈患有某些疾病，如风疹、流感、乙脑等，都可能损害胎儿的听力。梅毒还可能导致胎儿先天性性耳聋。
妊娠期间，准妈妈患有某些疾病阻碍了孕妇和胎儿的新陈代谢，也可能导致胎儿耳朵畸形。比如甲状腺功能低下，可能引起胎儿内耳畸形，患有妊娠糖尿病的孕妇胎儿患有先天性畸形的几率也会增加。
