如果大剂量服用秋水仙碱有可能会发生腹痛、腹泻、呕吐和食欲不振的不良反应，严重者可以因为腹泻导致脱水和电解质紊乱。有的病人因恶心呕吐或者腹泻较为严重而无法坚持用药。
秋水仙碱还可能引起亚急性的肌肉和外周神经毒性，常见于肾功能不全的患者。
长期应用秋水仙碱抑制骨髓造血功能是中毒常见的表现，可出现血小板减少，中性粒细胞下降，甚至 再生障碍性贫血。
秋水仙碱可引起肝功能异常，严重者可发生黄疸。
部分人群服用秋水仙碱有可能会出现皮疹、脱发，发热，男性会有少精或者无精发生，女性会有闭经或者痛经发生。
1、可引起可逆性维生素B12吸收不良。
2、胃肠道反应通常是对本品不能耐受或中毒的前驱症状，应及时减量或停药。
3、噻嗪类利尿药与秋水仙碱同时应用，会影响其抗痛风疗效。
4、孕妇服用可致畸胎，老年人易发生积蓄中毒，应慎用。
